Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms