Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms