Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM20AQ96MK3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms