Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC74BQ96LY2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC74BQ96LY2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC74BQ96LY2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC74BQ96LY2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC74BQ96LY2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC74BQ96LY2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC74BQ96LY2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC74BQ96LY2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC74BQ96LY2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC74BQ96LY2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC74BQ96LY2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC74BQ96LY2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC74BQ96LY2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC74BQ96LY2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC74BQ96LY2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC74BQ96LY2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC74BQ96LY2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC74BQ96LY2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC74BQ96LY2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC74BQ96LY2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC74BQ96LY2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC74BQ96LY2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC74BQ96LY2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC74BQ96LY2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC74BQ96LY2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms