Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC17Q96LX7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms