Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms