Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHDQ96IW2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms