Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms