Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APIPQ96GX9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms