Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms