Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EDC3Q96F86 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms