Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP36Q96EU6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms