Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms