Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NEURL3Q96EH8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms