Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms