Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG4CQ96DT6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms