Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC39Q96DD0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC39Q96DD0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms