Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ECHDC3Q96DC8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECHDC3Q96DC8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3Q96DC8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3Q96DC8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3Q96DC8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3Q96DC8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3Q96DC8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3Q96DC8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3Q96DC8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3Q96DC8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3Q96DC8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3Q96DC8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3Q96DC8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3Q96DC8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3Q96DC8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECHDC3Q96DC8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3Q96DC8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3Q96DC8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3Q96DC8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3Q96DC8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3Q96DC8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3Q96DC8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3Q96DC8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3Q96DC8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3Q96DC8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECHDC3Q96DC8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ECHDC3Q96DC8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ECHDC3Q96DC8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC3Q96DC8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ECHDC3Q96DC8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHDC3Q96DC8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHDC3Q96DC8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHDC3Q96DC8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHDC3Q96DC8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHDC3Q96DC8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHDC3Q96DC8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHDC3Q96DC8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHDC3Q96DC8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHDC3Q96DC8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECHDC3Q96DC8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECHDC3Q96DC8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms