Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC11Q96DB2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms