Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF183Q96D59 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF183Q96D59 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms