Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC74AQ96AQ1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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