Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
MKL1Q969V6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms