Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM54Q969K7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM54Q969K7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms