Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFKQ969G6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms