Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms