Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HPS3Q969F9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms