Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCAMP4Q969E2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms