Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP13Q92995 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP13Q92995 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP13Q92995 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP13Q92995 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP13Q92995 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP13Q92995 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP13Q92995 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP13Q92995 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP13Q92995 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP13Q92995 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP13Q92995 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP13Q92995 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP13Q92995 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP13Q92995 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP13Q92995 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP13Q92995 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP13Q92995 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP13Q92995 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
USP13Q92995 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP13Q92995 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP13Q92995 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP13Q92995 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP13Q92995 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP13Q92995 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP13Q92995 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP13Q92995 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP13Q92995 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP13Q92995 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP13Q92995 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP13Q92995 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP13Q92995 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP13Q92995 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP13Q92995 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
USP13Q92995 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP13Q92995 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP13Q92995 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP13Q92995 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP13Q92995 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP13Q92995 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP13Q92995 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP13Q92995 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP13Q92995 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP13Q92995 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP13Q92995 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP13Q92995 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP13Q92995 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP13Q92995 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP13Q92995 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
USP13Q92995 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP13Q92995 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP13Q92995 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP13Q92995 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP13Q92995 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP13Q92995 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP13Q92995 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP13Q92995 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP13Q92995 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP13Q92995 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP13Q92995 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP13Q92995 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP13Q92995 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP13Q92995 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP13Q92995 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP13Q92995 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP13Q92995 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP13Q92995 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP13Q92995 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP13Q92995 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP13Q92995 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP13Q92995 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP13Q92995 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP13Q92995 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP13Q92995 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP13Q92995 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP13Q92995 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP13Q92995 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP13Q92995 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP13Q92995 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP13Q92995 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP13Q92995 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP13Q92995 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP13Q92995 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP13Q92995 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP13Q92995 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP13Q92995 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP13Q92995 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP13Q92995 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP13Q92995 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP13Q92995 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP13Q92995 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP13Q92995 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP13Q92995 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP13Q92995 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP13Q92995 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP13Q92995 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP13Q92995 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP13Q92995 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP13Q92995 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP13Q92995 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms