Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWL2

SPIRE2, Protein spire homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE2Q8WWL2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPIRE2Q8WWL2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPIRE2Q8WWL2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms