Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW32

HMGB4, High mobility group protein B4, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB4Q8WW32 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB4Q8WW32 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGB4Q8WW32 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGB4Q8WW32 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGB4Q8WW32 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGB4Q8WW32 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGB4Q8WW32 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGB4Q8WW32 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGB4Q8WW32 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGB4Q8WW32 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGB4Q8WW32 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGB4Q8WW32 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGB4Q8WW32 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGB4Q8WW32 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGB4Q8WW32 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB4Q8WW32 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB4Q8WW32 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB4Q8WW32 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB4Q8WW32 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB4Q8WW32 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB4Q8WW32 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB4Q8WW32 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB4Q8WW32 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms