Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVF5

KCTD4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD4Q8WVF5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCTD4Q8WVF5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms