Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUM0

NUP133, Nuclear pore complex protein Nup133, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP133Q8WUM0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUP133Q8WUM0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP133Q8WUM0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms