Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY2

RFWD2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, humanhuman

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD2Q8NHY2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RFWD2Q8NHY2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFWD2Q8NHY2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms