Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF169Q8NCN4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
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