Protein–RNA interactions for Protein: Q8N999

C12orf29, Uncharacterized protein C12orf29, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf29Q8N999 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C12orf29Q8N999 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C12orf29Q8N999 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C12orf29Q8N999 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C12orf29Q8N999 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C12orf29Q8N999 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf29Q8N999 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf29Q8N999 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf29Q8N999 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf29Q8N999 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms