Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8V2

GBP7, Guanylate-binding protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP7Q8N8V2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP7Q8N8V2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP7Q8N8V2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP7Q8N8V2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP7Q8N8V2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP7Q8N8V2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP7Q8N8V2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP7Q8N8V2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP7Q8N8V2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP7Q8N8V2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP7Q8N8V2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP7Q8N8V2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP7Q8N8V2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP7Q8N8V2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP7Q8N8V2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP7Q8N8V2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP7Q8N8V2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP7Q8N8V2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP7Q8N8V2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP7Q8N8V2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP7Q8N8V2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP7Q8N8V2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP7Q8N8V2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP7Q8N8V2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP7Q8N8V2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP7Q8N8V2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GBP7Q8N8V2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP7Q8N8V2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP7Q8N8V2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP7Q8N8V2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms