Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms