Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5J2

MINDY1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY1Q8N5J2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms