Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J5

PPM1K, Protein phosphatase 1K, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1KQ8N3J5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPM1KQ8N3J5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms