Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z3

SPICE1, Spindle and centriole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPICE1Q8N0Z3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SPICE1Q8N0Z3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms