Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOT2Q8IXI1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOT2Q8IXI1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOT2Q8IXI1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOT2Q8IXI1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOT2Q8IXI1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOT2Q8IXI1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOT2Q8IXI1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOT2Q8IXI1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOT2Q8IXI1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOT2Q8IXI1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOT2Q8IXI1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOT2Q8IXI1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOT2Q8IXI1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOT2Q8IXI1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOT2Q8IXI1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOT2Q8IXI1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RHOT2Q8IXI1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOT2Q8IXI1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOT2Q8IXI1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOT2Q8IXI1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOT2Q8IXI1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RHOT2Q8IXI1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOT2Q8IXI1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOT2Q8IXI1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOT2Q8IXI1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOT2Q8IXI1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOT2Q8IXI1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOT2Q8IXI1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOT2Q8IXI1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOT2Q8IXI1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOT2Q8IXI1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOT2Q8IXI1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms