Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTN4Q8IWV2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms