Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms