Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRSK2Q8IWQ3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms