Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM8

SLC22A9, Solute carrier family 22 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A9Q8IVM8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC22A9Q8IVM8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms