Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI8

CRLF3, Cytokine receptor-like factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLF3Q8IUI8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRLF3Q8IUI8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRLF3Q8IUI8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRLF3Q8IUI8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRLF3Q8IUI8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRLF3Q8IUI8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRLF3Q8IUI8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRLF3Q8IUI8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRLF3Q8IUI8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRLF3Q8IUI8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRLF3Q8IUI8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRLF3Q8IUI8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRLF3Q8IUI8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRLF3Q8IUI8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRLF3Q8IUI8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRLF3Q8IUI8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRLF3Q8IUI8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRLF3Q8IUI8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CRLF3Q8IUI8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRLF3Q8IUI8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRLF3Q8IUI8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRLF3Q8IUI8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRLF3Q8IUI8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRLF3Q8IUI8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRLF3Q8IUI8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRLF3Q8IUI8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRLF3Q8IUI8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CRLF3Q8IUI8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRLF3Q8IUI8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRLF3Q8IUI8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRLF3Q8IUI8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRLF3Q8IUI8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms