Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IFNL1Q8IU54 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IFNL1Q8IU54 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
IFNL1Q8IU54 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFNL1Q8IU54 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms