Protein–RNA interactions for Protein: Q86VH5

LRRTM3, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3Q86VH5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRTM3Q86VH5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRTM3Q86VH5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRTM3Q86VH5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRTM3Q86VH5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRTM3Q86VH5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRTM3Q86VH5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRTM3Q86VH5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRTM3Q86VH5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRTM3Q86VH5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRTM3Q86VH5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRTM3Q86VH5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRTM3Q86VH5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRTM3Q86VH5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRTM3Q86VH5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRTM3Q86VH5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRTM3Q86VH5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRTM3Q86VH5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRTM3Q86VH5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRTM3Q86VH5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRTM3Q86VH5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRTM3Q86VH5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRTM3Q86VH5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRTM3Q86VH5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRTM3Q86VH5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRTM3Q86VH5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRTM3Q86VH5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRTM3Q86VH5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRTM3Q86VH5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRTM3Q86VH5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRTM3Q86VH5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRTM3Q86VH5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRTM3Q86VH5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRTM3Q86VH5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRTM3Q86VH5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRTM3Q86VH5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRTM3Q86VH5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRTM3Q86VH5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRTM3Q86VH5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRTM3Q86VH5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRTM3Q86VH5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRTM3Q86VH5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRTM3Q86VH5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms