Protein–RNA interactions for Protein: Q86VH4

LRRTM4, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4Q86VH4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRTM4Q86VH4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRTM4Q86VH4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRTM4Q86VH4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRTM4Q86VH4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRTM4Q86VH4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRTM4Q86VH4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRTM4Q86VH4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRTM4Q86VH4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRTM4Q86VH4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRTM4Q86VH4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRTM4Q86VH4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRTM4Q86VH4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRTM4Q86VH4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRTM4Q86VH4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRTM4Q86VH4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRTM4Q86VH4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRTM4Q86VH4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRTM4Q86VH4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRTM4Q86VH4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRTM4Q86VH4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRTM4Q86VH4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRTM4Q86VH4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRTM4Q86VH4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRTM4Q86VH4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRTM4Q86VH4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRTM4Q86VH4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRTM4Q86VH4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRTM4Q86VH4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRTM4Q86VH4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRTM4Q86VH4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRTM4Q86VH4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRTM4Q86VH4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRTM4Q86VH4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRTM4Q86VH4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRTM4Q86VH4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRTM4Q86VH4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRTM4Q86VH4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRTM4Q86VH4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms