Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC6BQ86SZ2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms