Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMC1Q7Z7K0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms